Hai UN solo bus usb 2.0 condiviso tra la chiavetta usb e quella wifi. Già questo limita non poco la velocità.
Io da un disco usb e ethernet cablata (pure lei sullo stesso bus usb 2.0) arrivavo a 7-8 MB/s.
Inoltre la rete wifi è più lenta di una cablata, solitamente, potrebbe anche essere questa la causa. Prova col cavo.
Poi c'è anche la chiavetta: 99% che è NTFS. Nel qual caso, ntfs-3g è parecchio cpu-intensive e uccide la cpu del raspberry -> rallentamento ulteriore.
Soluzione? Inizia a usare una memoria di massa formattata ext4/xfs e ci saranno miglioramenti di sicuro.
Leva il wifi e usa un cavo.
Così a 7-8MB/s dovresti arrivare.
Se vuoi velocità maggiori, dimenticati del raspberry (anche il 2 ha questa gestione idiota degli I/O) e passa ad altro, ad esempio bananapi (lan gigabit reale, usb ognuna con un bus dedicato, porta sata, cpu di potenza simile al raspi 2, ecc ecc).
Col bananapi trasferisco da un disco (xfs) attaccato alla usb 2.0 a circa 20-22 MB/s costanti.